Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXA5

KHDC1, KH homology domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC1Q4VXA5 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KHDC1Q4VXA5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms