Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC004466.2-201ENST00000614749 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LAMA3Q16787 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LAMA3Q16787 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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