Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BNC1Q01954 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms