Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Myo5a-206ENSMUST00000136731 6480 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm5218F6YH22 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms