Protein–RNA interactions for Protein: E0CXM8

Gm43720, Predicted gene 43720, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm43720E0CXM8 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm43720E0CXM8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm43720E0CXM8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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