Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PSDA5PKW4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PSDA5PKW4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms