Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0G0

ZNF407, Zinc finger protein 407, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF407Q9C0G0 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ZNF407Q9C0G0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms