Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Ccdc113Q8C5T8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Ccdc113Q8C5T8 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Ccdc113Q8C5T8 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ccdc113Q8C5T8 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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