Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Fam208bQ5DTT3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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