Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
V1rd19Q3KNP5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms