Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
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