Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXD13P35453 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXD13P35453 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms