Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SLC28A2O43868 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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