Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
BC048679D3YXE9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
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BC048679D3YXE9 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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BC048679D3YXE9 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
BC048679D3YXE9 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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