Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Ercc8Q8CFD5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
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Ercc8Q8CFD5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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Ercc8Q8CFD5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ercc8Q8CFD5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
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