Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
APOFQ13790 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
APOFQ13790 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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