Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Scg2Q03517 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms