Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PTPRDP23468 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRDP23468 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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PTPRDP23468 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PTPRDP23468 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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