Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm3099J3QPA5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm3099J3QPA5 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms