Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Cldn34c3J3QJW5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms