Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Fam50bQ9WTJ8 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms