Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
COPS7AQ9UBW8 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms