Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SEMA4BQ9NPR2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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