Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ATP2B3Q16720 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
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