Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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SPIDRQ14159 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SPIDRQ14159 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SPIDRQ14159 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIDRQ14159 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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