Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ABCC8Q09428 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCC8Q09428 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms