Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cacna1cQ01815 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cacna1cQ01815 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms