Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fam50bQ9WTJ8 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms