Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MBD1Q9UIS9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms