Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms