Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Usp1Q8BJQ2 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Usp1Q8BJQ2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms