Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Dsg1bQ7TSF1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Dsg1bQ7TSF1 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Dsg1bQ7TSF1 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Dsg1bQ7TSF1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Dsg1bQ7TSF1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Dsg1bQ7TSF1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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