Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC174Q6PII3 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms