Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAEP38570 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAEP38570 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms