Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GJA4P35212 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GJA4P35212 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms