Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tlr5Q9JLF7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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