Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
C2orf48Q96LS8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms