Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C18orf8Q96DM3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms