Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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GABRA6Q16445 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABRA6Q16445 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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