Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HTR4Q13639 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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