Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm20834-202ENSMUST00000185576 1220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm13780-201ENSMUST00000150482 1187 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Sh3bp2Q06649 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms