Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tgm4-201ENSMUST00000026893 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Pxmp4-201ENSMUST00000000896 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Retsat-201ENSMUST00000070597 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Prss23-204ENSMUST00000207932 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tuba4a-202ENSMUST00000186213 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 1810034E14Rik-201ENSMUST00000181403 1805 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Wdr20rt-202ENSMUST00000221658 1570 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Hmgcs1-202ENSMUST00000224188 3464 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tnfrsf9-204ENSMUST00000105672 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm26790-201ENSMUST00000181078 2291 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Olfr140-203ENSMUST00000216475 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tnfaip1-201ENSMUST00000017759 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Slc36a2-201ENSMUST00000039305 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm12695-201ENSMUST00000107071 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Itgam-203ENSMUST00000106242 4649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Acer2-201ENSMUST00000045224 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Olfr721-ps1-201ENSMUST00000165291 975 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 4930417O13Rik-203ENSMUST00000204911 3458 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm4894-202ENSMUST00000216428 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ankk1-201ENSMUST00000034792 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cnga3-201ENSMUST00000027288 3554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Alppl2-201ENSMUST00000027455 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Alox8-201ENSMUST00000021262 3226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Zmynd8-204ENSMUST00000109262 2515 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Adam17-201ENSMUST00000064536 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Rps28P62858 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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