Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ERVK-21P61565 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms