Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Gm43339-201ENSMUST00000200032 1606 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
P01649 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
P01649 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
P01649 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01649 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms