Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
MTSS1O43312 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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