Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms