Protein–RNA interactions for Protein: V9GXJ1

Gm28036, Predicted gene, 28036, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28036V9GXJ1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm28036V9GXJ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm28036V9GXJ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm28036V9GXJ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm28036V9GXJ1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms