Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CPNE7Q9UBL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CPNE7Q9UBL6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE7Q9UBL6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms