Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lmbr1Q9JIT0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Lmbr1Q9JIT0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lmbr1Q9JIT0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms