Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ROBO3Q96MS0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ROBO3Q96MS0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ROBO3Q96MS0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms